Reconstitution exhaustive d’un génome bactérien grâce à un nouveau logiciel développé aux HUG

Reconstitution exhaustive d’un génome bactérien grâce à un nouveau logiciel développé aux HUG

Les techniques de laboratoire les plus récentes permettent de lire la totalité d’un génome bactérien. Cependant, cette lecture produit des millions de petits fragments de séquence qu’il faut ensuite assembler à la manière d’un immense puzzle. Jusqu’à ce jour, les outils informatiques disponibles n’obtenaient qu’une reconstitution partielle des génomes, et seules de laborieuses analyses complémentaires conduisent à la résolution complète du génome. Le Logiciel développé au sein du laboratoire de recherche génomique des HUG, dirigé par le Professeur Jacques Schrenzel, a pour la première fois reconstitué totalement, au nucléotide près, les 3 millions de bases du génome d’une souche de staphylocoque doré.

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